El manejo de la hidatidosis depende de la fase de la enfermedad. En los casos de equinococosis quística, la forma más común de tratamiento es la extirpación quirúrgica de los quistes en combinación con antiparasitarios como albendazol y/o mebendazol antes y después de la cirugía. Los quistes más chicos pueden ser aspirados con una técnica de punción-aspiración-inyección-reaspiración (PAIR). En caso de múltiples quistes o de quistes inoperables se puede tomar los antiparasitarios por 2 a 6 meses
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